H19 upstream region
== Bisulfite Genomic Sequencing Results == Cytosine . . ... .. . # ... Summary Y Genomic GGAGATACTAGGGGAACAATGAGGTGTCCCAGTTCCATGGATGATGGGGATCTCGGCCCT Reference GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTYGGTTTT ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-A2 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-A3 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTCGGTTTT H19-A4 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-A6 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-A8 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-A9 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-B2 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-B4 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT H19-C1 GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT Cytosine ... . # . . . . . . ..# . . . Summary U U E Genomic AGTGTGAAACCCTTCTCGCAGGGTCTCTGGCAGGCACAGAGCCCGGGGG-CTCTTGCATA Reference AGTGTGAAATTTTTTTYGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTYGGGGG-TTTTTGTATA ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGGGTTTTTGTATA H19-A2 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-A3 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-A4 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-A6 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-A8 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-A9 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-B2 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-B4 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA H19-C1 AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA Cytosine . . . . . .. # . . .# .. . # Summary EU U U Genomic GCACATGGGTATTTCTGGAGGCTTCTCCTTCGGTCTCACCGCCTGGATGGCACGGAATTG Reference GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTYGGTTTTATYGTTTGGATGGTAYGGAATTG ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A2 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A3 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A4 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A6 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A8 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTT-TGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-A9 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTT-TGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-B2 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-B4 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG H19-C1 GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG Cytosine # .# # # # . . . . . . . . . Summary U U U U U Genomic GTTGTAGTTGTGGAATCGGAAGTGGCCGCGCGGCGGCAGTGCAGGCTCACACATCACAGC Reference GTTGTAGTTGTGGAATYGGAAGTGGTYGYGYGGYGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A2 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A3 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A4 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A6 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A8 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-A9 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-B2 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-B4 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT H19-C1 GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT Cytosine .# ..# .... . # ..# # ..# . ... .. # # Summary U U U U U U U U Genomic CCGAGCCCGCCCCAACTGGGGTTCGCCCGTGGAAACGTCCCGGGTCACCCAAGCCACGCG Reference TYGAGTTYGTTTTAATTGGGGTTYGTTYGTGGAAAYGTTTYGGGTTATTTAAGTTAYGYG ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A2 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A3 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A4 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A6 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A8 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-A9 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-B2 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-B4 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG H19-C1 TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG Cytosine # . . # . . . . . .# . .. . Summary U U U Genomic TCGCAGGGTTCACGGGGGTCATCTGGGAATAGGACACTCATAGGAGCCGCACCAGATCTT Reference TYGTAGGGTTTAYGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTYGTATTAGATTTT ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A2 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A3 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A4 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A6 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A8 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-A9 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-B2 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-B4 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT H19-C1 TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT Cytosine . # . .. . ...# ...# . . . .# Summary U U Y Y Genomic CAGGTCGGGCATTATCCACAGCCCCGTGGCCCCGGGTCACACTCC Reference TAGGTYGGGTATTATTTATAGTTTYGTGGTTTYGGGTTATATTTY ------------ ------------------------------------------------------------ H19-A1 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTCGGGTTATATTTC H19-A2 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-A3 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-A4 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-A6 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-A8 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-A9 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTCGGGTTATATTTC H19-B2 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-B4 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT H19-C1 TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT == Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates == H19-A1 CpG 26-> 24 TpG 7.69% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A2 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A3 CpG 26-> 25 TpG 3.85% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A4 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A6 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A8 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-A9 CpG 26-> 24 TpG 7.69% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-B2 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-B4 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv H19-C1 CpG 26-> 26 TpG 0.00% meth, CpH 94-> 94 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1 promoter
== Bisulfite Genomic Sequencing Results == Cytosine # . . ...# . # # . # ... . . . Summary M Y E M Y PM Genomic CGCTGAGAGGCACCCCGGCAGAATCGCGCTGAGGGRCGCCCTGGCAGGATCTTGCTGAGG Reference YGTTGAGAGGTATTTYGGTAGAATYGYGTTGAGGGRYGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-A3 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGGATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-A4 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGTGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-A6 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-A7 CGTTGAGAGGTATTTTGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-A10 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-B5 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-C1 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-C2 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG KCNQ1OT1-C3 CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG Cytosine . ... .# . # # # # .# . .. . # . Summary X M Y M M Y Y M Genomic AGCTCCCTGGAGGTCCGTGCTGAGGCGACGCGGCGACCGTTCTGCCTGGAGACTGCGGCA Reference AGTTTTTTGGAGGTTYGTGTTGAGGYGAYGYGGYGATYGTTTTGTTTGGAGATTGYGGTA ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGTGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-A3 AGCTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-A4 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGTGACGCGGTGATTGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-A6 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-A7 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATTGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-A10 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-B5 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-C1 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-C2 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGTGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA KCNQ1OT1-C3 AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA Cytosine # . .# . ....# .# . .# # # .# ...... .. . # Summary Y Y X Y Y X Y Y Y Y X Y Genomic GCGCTCCGACTGCCCCCGCCGCTGCCGACGTGGCGACCGCCCCCCACCTGCTGATTGGGC Reference GYGTTTYGATTGTTTTYGTYGTTGTYGAYGTGGYGATYGTTTTTTATTTGTTGATTGGGY ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 GTGTTTCGATTGTTTTTGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-A3 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGCTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGCTGATTGGGC KCNQ1OT1-A4 GTGTTTTGATTGTTTTTGTTGTTGTTGATGTGGTGATTGTTTTTTATTTGTTGATTGGGT KCNQ1OT1-A6 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-A7 GCGTTTCGACTGTTTTCGTCGCTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-A10 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-B5 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-C1 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-C2 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC KCNQ1OT1-C3 GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC Cytosine . . . # # . . . # . # Summary Y Y X Y M Genomic GGCAGCAGGGGAAGGCTTGCGGCGGGCTGCTGCACGGATTGGCTGGGTGCGGAAAGTGAT Reference GGTAGTAGGGGAAGGTTTGYGGYGGGTTGTTGTAYGGATTGGTTGGGTGYGGAAAGTGAT ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-A3 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGCTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-A4 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGTGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-A6 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-A7 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGCTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-A10 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-B5 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGTGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-C1 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-C2 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT KCNQ1OT1-C3 GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT Cytosine .# .. . .# . .. ..# . . Summary Y X Y X X Y Genomic GTGCCGTGTCCTGTCATTGGCCGAAAGAGTCTGGTTTTGATGCCACCCGGGCTCAGATTG Reference GTGTYGTGTTTTGTTATTGGTYGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTYGGGTTTAGATTG ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-A3 GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-A4 GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTTGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-A6 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-A7 GTGTCGTGTTCTGTTATTGGTCGAAAGAGTCTGGTTTTGATGTCATTTGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-A10 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-B5 GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-C1 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-C2 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG KCNQ1OT1-C3 GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG Cytosine ... # .. # .# . Summary X M X M XY Genomic GCCCAGCGGGTCCAGCGCCGC Reference GTTTAGYGGGTTTAGYGTYGT ------------ ------------------------------------------------------------ KCNQ1OT1-A1 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-A3 GTTTAGCGGGTTCAGCGTCGT KCNQ1OT1-A4 GTTTAGCGGGTTTAGCGTTGT KCNQ1OT1-A6 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-A7 GTTCAGCGGGTTTAGCGCCGT KCNQ1OT1-A10 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-B5 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-C1 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-C2 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT KCNQ1OT1-C3 GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT == Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates == KCNQ1OT1-A1 CpG 31-> 3 TpG 90.32% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-A3 CpG 31-> 1 TpG 96.77% meth, CpH 71-> 66 TpH 92.96% conv KCNQ1OT1-A4 CpG 31-> 18 TpG 41.94% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-A6 CpG 31-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-A7 CpG 31-> 3 TpG 90.32% meth, CpH 71-> 63 TpH 88.73% conv KCNQ1OT1-A10 CpG 31-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-B5 CpG 31-> 3 TpG 90.32% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-C1 CpG 31-> 1 TpG 96.77% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-C2 CpG 31-> 2 TpG 93.55% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv KCNQ1OT1-C3 CpG 31-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 71-> 71 TpH 100.00% conv
IGF2R intron
== Bisulfite Genomic Sequencing Results == Cytosine # .. . . . . . .. # # Summary Y X Y Y Genomic CGAGGCCTGGCATGTTGGGGACAGGTCTTGGGAGCTGACTGGGGGCCTGGCGTGGTGGCG Reference YGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGYGTGGTGGYG ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-A5 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-A7 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTCTGGCGTGGTGGCG IGF2R-A8 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-A9 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-A10 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-B1 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-B3 TGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGTGTGGTGGTG IGF2R-B5 TGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG IGF2R-B6 CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGTGTGGTGGCG Cytosine . ..# . ... .. ... . .# # . . # .. . # Summary Y Y Y Y Y Genomic GCAGCCCGCAGTCCCTGCCTGGCCCTTGTCTGGGAGGCCGCGGTTCTCTGCGGCCTCTCG Reference GTAGTTYGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTYGYGGTTTTTTGYGGTTTTTYG ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-A5 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGTGGTTTTTCG IGF2R-A7 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-A8 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-A9 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-A10 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-B1 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG IGF2R-B3 GTAGTTTGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGTGGTTTTTTGTGGTTTTTTG IGF2R-B5 GTAGTTTGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGTGGTTTTTTGTGGTTTTTCG IGF2R-B6 GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG Cytosine .# # ... .. . . # .# # # ...# Summary Y P Y Y Y Y Y Y Genomic CCGGKGTCGCCCTTGGCCACTGGGCTGCGAGGAAGCCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGCCCC Reference TYGGKGTYGTTTTTGGTTATTGGGTTGYGAGGAAGTYGGYGAGGAGTGGGTGTGYGTTTY ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-A5 TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-A7 TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-A8 TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-A9 TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-A10 TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-B1 TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-B3 TTGGTGTTGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTTGGTGAGGAGTGGGTGTGTGTTTT IGF2R-B5 TTGGTGTTGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTTGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC IGF2R-B6 TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGTGTTTC Cytosine ..# . . .# # . .# .. # .# # . . . Summary Y Y Y Y M Y M Genomic GCCCGGCTCTACCGGCGAGGGATGCAGTGGCCGCCAGCGTGGCCGTGCGGCTGGGTCACT Reference GTTYGGTTTTATYGGYGAGGGATGTAGTGGTYGTTAGYGTGGTYGTGYGGTTGGGTTATT ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-A5 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-A7 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-A8 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-A9 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-A10 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-B1 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-B3 GTTTGGTTTTATTGGTGAGGGATGTAGTGGTTGTTAGCGTGGTTGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-B5 GTTCGGTTTTATTGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT IGF2R-B6 GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT Cytosine ... ..# . .. .. . .. .. . # ..# . . Summary Y E EEX Y Y Genomic CCCTTCCCGCTTCCAGGGCCTTTTTCTGCCTCCTTTT-CAGGACGTGACCCGCACATTAT Reference TTTTTTTYGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGAYGTGATTYGTATATTAT ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-A5 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-A7 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-A8 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTT-GTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-A9 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-A10 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTT-GTTTTTTTT--TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-B1 TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-B3 TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT IGF2R-B5 TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGATGTGATTTGTATATTAT IGF2R-B6 TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-CAGGACGTGATTCGTATATTAT Cytosine ..# . . . . . ... . # Summary Y M Genomic GAGGGACCCGTAGGGGCTCTTGACACAGAGGGGTCACCCTATGTGTGAACAGGTTACGAG Reference GAGGGATTYGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTAYGAG ------------ ------------------------------------------------------------ IGF2R-A4 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-A5 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-A7 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-A8 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-A9 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-A10 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-B1 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-B3 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-B5 GAGGGATTTGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG IGF2R-B6 GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG == Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates == IGF2R-A4 CpG 27-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-A5 CpG 27-> 1 TpG 96.30% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-A7 CpG 27-> 1 TpG 96.30% meth, CpH 84-> 83 TpH 98.81% conv IGF2R-A8 CpG 27-> 1 TpG 96.30% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-A9 CpG 27-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-A10 CpG 27-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-B1 CpG 27-> 2 TpG 92.59% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-B3 CpG 27-> 21 TpG 22.22% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-B5 CpG 27-> 14 TpG 48.15% meth, CpH 84-> 84 TpH 100.00% conv IGF2R-B6 CpG 27-> 2 TpG 92.59% meth, CpH 84-> 83 TpH 98.81% conv
SNRPN promoter
== Bisulfite Genomic Sequencing Results == Cytosine . .# . .... . . # . . . # .. # Summary Y Y X Y Y Genomic GTCATTCCGGTGAGGGAGGGAGCTGGGACCCCTGCACTGCGGCAAACAAGCACGCCTGCG Reference GTTATTTYGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGYGGTAAATAAGTAYGTTTGYG ------------ ------------------------------------------------------------ SNRPN-A1 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAACAAGTACGTTTGCG SNRPN-A2 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A3 GTTATTTTGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A4 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A5 GTTATTTTGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGTG SNRPN-A6 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A7 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A8 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG SNRPN-A10 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTATGTTTGCG SNRPN-B2 GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGTGGTAAATAAGTACGTTTGCG Cytosine # .# . . . # # . . . # # .. .# . Summary M Y M M M M M Genomic CGGCCGCAGAGGCAGGCTGGCGCGCATGCTCAGGCGGGGATGTGTGCGAAGCCTGCCGCT Reference YGGTYGTAGAGGTAGGTTGGYGYGTATGTTTAGGYGGGGATGTGTGYGAAGTTTGTYGTT ------------ ------------------------------------------------------------ SNRPN-A1 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A2 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A3 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A4 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A5 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A6 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A7 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A8 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-A10 CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT SNRPN-B2 CGGTTGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT Cytosine . . # . # . # .# .# .. # . . . Summary M M M Y M M Genomic GCTGCAGCGAGTCTGGCGCAGAGTGGAGCGGCCGCCGGAGATGCCTGACGCATCTGTCTG Reference GTTGTAGYGAGTTTGGYGTAGAGTGGAGYGGTYGTYGGAGATGTTTGAYGTATTTGTTTG ------------ ------------------------------------------------------------ SNRPN-A1 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A2 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A3 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTTGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A4 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A5 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A6 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A7 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A8 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-A10 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG SNRPN-B2 GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG Cytosine # . # # # . . . .# . . . . Summary Y M M M Y Genomic AGGAGCGGTCAGTGACGCGATGGAGCGGGCAAGGTCAGCTGTGCCGGTGGCTTCTCTCAA Reference AGGAGYGGTTAGTGAYGYGATGGAGYGGGTAAGGTTAGTTGTGTYGGTGGTTTTTTTTAA ------------ ------------------------------------------------------------ SNRPN-A1 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A2 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A3 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTTGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A4 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A5 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A6 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A7 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTTGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A8 AGGAGTGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-A10 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA SNRPN-B2 AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA Cytosine . .. # .. . . Summary E Y Genomic GAGACAGCCTGGGGAGCGGCCACTTTTATTCAT Reference GAGATAGTTTGGGGAGYGGTTATTTTTATTTAT ------------ ------------------------------------------------------------ SNRPN-A1 GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A2 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A3 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A4 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A5 GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A6 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A7 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A8 GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-A10 GGGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT SNRPN-B2 GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT == Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates == SNRPN-A1 CpG 23-> 1 TpG 95.65% meth, CpH 52-> 51 TpH 98.08% conv SNRPN-A2 CpG 23-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A3 CpG 23-> 3 TpG 86.96% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A4 CpG 23-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A5 CpG 23-> 3 TpG 86.96% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A6 CpG 23-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A7 CpG 23-> 1 TpG 95.65% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A8 CpG 23-> 1 TpG 95.65% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-A10 CpG 23-> 2 TpG 91.30% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv SNRPN-B2 CpG 23-> 3 TpG 86.96% meth, CpH 52-> 52 TpH 100.00% conv
MEST promoter
== Bisulfite Genomic Sequencing Results == Cytosine # . . # # ..# . . . # . # # # . # # Summary Y Y Y X Y Y Y Y Y Y Y Genomic GCGGGCTCTGCGGCGCCCGGTGCTCTGCAACGCTGCGGCGGGCGGCATGGGATAACGCGG Reference GYGGGTTTTGYGGYGTTYGGTGTTTTGTAAYGTTGYGGYGGGYGGTATGGGATAAYGYGG ------------ ------------------------------------------------------------ MEST-A2 GTGGGTTTTGTGGCGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-A3 GCGGGTTTTGCGGCGTTCGGTGTTTTGTAACGTTGCGGCGGGCGGTATGGGATAACGCGG MEST-A7 GTGGGTTTTGCGGCGTTCGGTGTTTTGTAACGTTGCGGCGGGCGGTATGGGATAACGCGG MEST-A8 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-A9 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-A10 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-B1 GTGGGTTTTGTGGTGCTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-B4 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-B5 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG MEST-B6 GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG Cytosine .. # .# # .. .# . # # . Summary Y Y Y Y Y Y Genomic CCATGGTGCGCCGAGATCGCCTCCGCAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGC Reference TTATGGTGYGTYGAGATYGTTTTYGTAGGTGAGTGTGYGGTGGGAAYGAGGGGGTGTGGT ------------ ------------------------------------------------------------ MEST-A2 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-A3 TTATGGTGCGTCGAGATCGTTTTCGTAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGT MEST-A7 TTATGGTGCGTCGAGATCGTTTTCGTAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGT MEST-A8 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-A9 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-A10 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-B1 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-B4 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-B5 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT MEST-B6 TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT Cytosine # ... . # . # # . ..# .# . Summary Y X Y Y E Y Y Y X Genomic TGGCGGCCCTGGGACTAGGGCGCAGGCGAGCGGAGGACTGTGTGCCCGTGTCCGAGCTGG Reference TGGYGGTTTTGGGATTAGGGYGTAGGYGAGYGGAGGATTGTGTGTTYGTGTTYGAGTTGG ------------ ------------------------------------------------------------ MEST-A2 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-A3 TGGCGGTTTTGGGATTAGGGCGTAGGCGAGCGGAGGATTGTGTGTTCGTGTTCGAGTTGG MEST-A7 TGGCGGTTTTGGGATTAGGGCGTAGGCGGGCGGAGGATTGTGTGTTCGTGTTCGAGTTGG MEST-A8 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTCGAGTTGG MEST-A9 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-A10 TGGTGGTCTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-B1 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-B4 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-B5 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG MEST-B6 TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGCTGG Cytosine . .. . # . . .# . # . # . .# # ..# . . .. Summary Y X Y X Y Y Y Y Y X Genomic GGCTGCCTCTGGGCGAAAACTCTACCGACAGGCGGCACGCATTCCGCGCCCGCTCTGCCT Reference GGTTGTTTTTGGGYGAAAATTTTATYGATAGGYGGTAYGTATTTYGYGTTYGTTTTGTTT ------------ ------------------------------------------------------------ MEST-A2 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-A3 GGTTGTTTTTGGGCGAAAACTTTATCGACAGGCGGTACGTATTTCGCGTTCGTTTTGCTT MEST-A7 GGTTGTTTTTGGGCGAAAATTTTATCGACAGGCGGTACGTATTTCGCGTTCGTTTTGTTT MEST-A8 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-A9 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-A10 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-B1 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-B4 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-B5 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT MEST-B6 GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT == Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates == MEST-A2 CpG 29-> 28 TpG 3.45% meth, CpH 44-> 44 TpH 100.00% conv MEST-A3 CpG 29-> 0 TpG 100.00% meth, CpH 44-> 41 TpH 93.18% conv MEST-A7 CpG 29-> 1 TpG 96.55% meth, CpH 44-> 43 TpH 97.73% conv MEST-A8 CpG 29-> 28 TpG 3.45% meth, CpH 44-> 44 TpH 100.00% conv MEST-A9 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 44 TpH 100.00% conv MEST-A10 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 43 TpH 97.73% conv MEST-B1 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 43 TpH 97.73% conv MEST-B4 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 44 TpH 100.00% conv MEST-B5 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 44 TpH 100.00% conv MEST-B6 CpG 29-> 29 TpG 0.00% meth, CpH 44-> 43 TpH 97.73% conv