Bisulfite Genomic Sequencing Results of DMRs from NT-1 cell

Keys


H19 upstream region

== Bisulfite Genomic Sequencing Results ==

Cytosine             .        .          ...    ..               . #  ... 
Summary                                                            Y      
Genomic       GGAGATACTAGGGGAACAATGAGGTGTCCCAGTTCCATGGATGATGGGGATCTCGGCCCT
Reference     GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTYGGTTTT
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-A2        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-A3        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTCGGTTTT
H19-A4        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-A6        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-A8        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-A9        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-B2        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-B4        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT
H19-C1        GGAGATATTAGGGGAATAATGAGGTGTTTTAGTTTTATGGATGATGGGGATTTTGGTTTT

Cytosine               ...  . # .     . .   .   . .    ..#      . .   .   
Summary                       U                          U     E          
Genomic       AGTGTGAAACCCTTCTCGCAGGGTCTCTGGCAGGCACAGAGCCCGGGGG-CTCTTGCATA
Reference     AGTGTGAAATTTTTTTYGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTYGGGGG-TTTTTGTATA
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGGGTTTTTGTATA
H19-A2        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-A3        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-A4        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-A6        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-A8        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-A9        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-B2        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-B4        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA
H19-C1        AGTGTGAAATTTTTTTTGTAGGGTTTTTGGTAGGTATAGAGTTTGGGGG-TTTTTGTATA

Cytosine       . .          .      .  . ..  #   . . .# ..       . #       
Summary                                    EU        U            U       
Genomic       GCACATGGGTATTTCTGGAGGCTTCTCCTTCGGTCTCACCGCCTGGATGGCACGGAATTG
Reference     GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTYGGTTTTATYGTTTGGATGGTAYGGAATTG
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A2        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A3        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A4        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A6        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A8        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTT-TGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-A9        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTT-TGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-B2        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-B4        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG
H19-C1        GTATATGGGTATTTTTGGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTATTGTTTGGATGGTATGGAATTG

Cytosine                      #        .# # #  #  .    .   . . . .  . .  .
Summary                       U         U U U  U                          
Genomic       GTTGTAGTTGTGGAATCGGAAGTGGCCGCGCGGCGGCAGTGCAGGCTCACACATCACAGC
Reference     GTTGTAGTTGTGGAATYGGAAGTGGTYGYGYGGYGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A2        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A3        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A4        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A6        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A8        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-A9        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-B2        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-B4        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT
H19-C1        GTTGTAGTTGTGGAATTGGAAGTGGTTGTGTGGTGGTAGTGTAGGTTTATATATTATAGT

Cytosine      .#   ..# ....  .       # ..#       #  ..#    . ...   .. # # 
Summary        U     U               U   U       U    U               U U 
Genomic       CCGAGCCCGCCCCAACTGGGGTTCGCCCGTGGAAACGTCCCGGGTCACCCAAGCCACGCG
Reference     TYGAGTTYGTTTTAATTGGGGTTYGTTYGTGGAAAYGTTTYGGGTTATTTAAGTTAYGYG
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A2        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A3        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A4        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A6        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A8        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-A9        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-B2        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-B4        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG
H19-C1        TTGAGTTTGTTTTAATTGGGGTTTGTTTGTGGAAATGTTTTGGGTTATTTAAGTTATGTG

Cytosine       # .      . #      .  .           . . .       .# . ..    .  
Summary        U          U                                  U            
Genomic       TCGCAGGGTTCACGGGGGTCATCTGGGAATAGGACACTCATAGGAGCCGCACCAGATCTT
Reference     TYGTAGGGTTTAYGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTYGTATTAGATTTT
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A2        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A3        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A4        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A6        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A8        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-A9        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-B2        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-B4        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT
H19-C1        TTGTAGGGTTTATGGGGGTTATTTGGGAATAGGATATTTATAGGAGTTGTATTAGATTTT

Cytosine      .    #   .     .. .  ...#    ...#    . . . .#
Summary            U                  U       Y           Y
Genomic       CAGGTCGGGCATTATCCACAGCCCCGTGGCCCCGGGTCACACTCC
Reference     TAGGTYGGGTATTATTTATAGTTTYGTGGTTTYGGGTTATATTTY
------------  ------------------------------------------------------------
H19-A1        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTCGGGTTATATTTC
H19-A2        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-A3        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-A4        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-A6        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-A8        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-A9        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTCGGGTTATATTTC
H19-B2        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-B4        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT
H19-C1        TAGGTTGGGTATTATTTATAGTTTTGTGGTTTTGGGTTATATTTT

== Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates ==

H19-A1        CpG  26-> 24 TpG   7.69% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A2        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A3        CpG  26-> 25 TpG   3.85% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A4        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A6        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A8        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-A9        CpG  26-> 24 TpG   7.69% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-B2        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-B4        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv
H19-C1        CpG  26-> 26 TpG   0.00% meth, CpH  94-> 94 TpH 100.00% conv


KCNQ1OT1 promoter

== Bisulfite Genomic Sequencing Results ==

Cytosine      # .       . ...#  .     # # .       # ...   .     .   .     
Summary       M              Y     E  M Y        PM                       
Genomic       CGCTGAGAGGCACCCCGGCAGAATCGCGCTGAGGGRCGCCCTGGCAGGATCTTGCTGAGG
Reference     YGTTGAGAGGTATTTYGGTAGAATYGYGTTGAGGGRYGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-A3   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGGATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-A4   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGTGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-A6   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-A7   CGTTGAGAGGTATTTTGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-A10  CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-B5   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-C1   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-C2   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGGCGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG
KCNQ1OT1-C3   CGTTGAGAGGTATTTCGGTAGAATCGCGTTGAGGGACGTTTTGGTAGGATTTTGTTGAGG

Cytosine        . ...       .#   .     #  # #  #  .#   .  ..      .  #  . 
Summary         X            M         Y  M M  Y   Y                 M    
Genomic       AGCTCCCTGGAGGTCCGTGCTGAGGCGACGCGGCGACCGTTCTGCCTGGAGACTGCGGCA
Reference     AGTTTTTTGGAGGTTYGTGTTGAGGYGAYGYGGYGATYGTTTTGTTTGGAGATTGYGGTA
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGTGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-A3   AGCTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-A4   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGTGACGCGGTGATTGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-A6   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-A7   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATTGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-A10  AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-B5   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-C1   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-C2   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGTGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA
KCNQ1OT1-C3   AGTTTTTTGGAGGTTCGTGTTGAGGCGACGCGGCGATCGTTTTGTTTGGAGATTGCGGTA

Cytosine       # . .#  .  ....# .# .  .#  #    #  .# ...... ..  .        #
Summary        Y    Y  X      Y  Y X   Y  Y    Y   Y            X        Y
Genomic       GCGCTCCGACTGCCCCCGCCGCTGCCGACGTGGCGACCGCCCCCCACCTGCTGATTGGGC
Reference     GYGTTTYGATTGTTTTYGTYGTTGTYGAYGTGGYGATYGTTTTTTATTTGTTGATTGGGY
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   GTGTTTCGATTGTTTTTGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-A3   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGCTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGCTGATTGGGC
KCNQ1OT1-A4   GTGTTTTGATTGTTTTTGTTGTTGTTGATGTGGTGATTGTTTTTTATTTGTTGATTGGGT
KCNQ1OT1-A6   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-A7   GCGTTTCGACTGTTTTCGTCGCTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-A10  GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-B5   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-C1   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-C2   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC
KCNQ1OT1-C3   GCGTTTCGATTGTTTTCGTCGTTGTCGACGTGGCGATCGTTTTTTATTTGTTGATTGGGC

Cytosine        .  .         .   #  #   .  .  . #       .      #          
Summary                          Y  Y      X    Y              M          
Genomic       GGCAGCAGGGGAAGGCTTGCGGCGGGCTGCTGCACGGATTGGCTGGGTGCGGAAAGTGAT
Reference     GGTAGTAGGGGAAGGTTTGYGGYGGGTTGTTGTAYGGATTGGTTGGGTGYGGAAAGTGAT
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-A3   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGCTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-A4   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGTGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-A6   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-A7   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGCTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-A10  GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-B5   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGTGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-C1   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-C2   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTATGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT
KCNQ1OT1-C3   GGTAGTAGGGGAAGGTTTGCGGCGGGTTGTTGTACGGATTGGTTGGGTGCGGAAAGTGAT

Cytosine         .#    ..   .     .#        .           .. ..#   . .      
Summary           Y     X          Y        X            X   Y            
Genomic       GTGCCGTGTCCTGTCATTGGCCGAAAGAGTCTGGTTTTGATGCCACCCGGGCTCAGATTG
Reference     GTGTYGTGTTTTGTTATTGGTYGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTYGGGTTTAGATTG
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-A3   GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-A4   GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTTGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-A6   GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-A7   GTGTCGTGTTCTGTTATTGGTCGAAAGAGTCTGGTTTTGATGTCATTTGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-A10  GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-B5   GTGTTGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-C1   GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-C2   GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG
KCNQ1OT1-C3   GTGTCGTGTTTTGTTATTGGTCGAAAGAGTTTGGTTTTGATGTTATTCGGGTTTAGATTG

Cytosine       ...  #    ..  # .# .
Summary          X  M     X  M XY  
Genomic       GCCCAGCGGGTCCAGCGCCGC
Reference     GTTTAGYGGGTTTAGYGTYGT
------------  ------------------------------------------------------------
KCNQ1OT1-A1   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-A3   GTTTAGCGGGTTCAGCGTCGT
KCNQ1OT1-A4   GTTTAGCGGGTTTAGCGTTGT
KCNQ1OT1-A6   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-A7   GTTCAGCGGGTTTAGCGCCGT
KCNQ1OT1-A10  GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-B5   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-C1   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-C2   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT
KCNQ1OT1-C3   GTTTAGCGGGTTTAGCGTCGT

== Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates ==

KCNQ1OT1-A1   CpG  31->  3 TpG  90.32% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-A3   CpG  31->  1 TpG  96.77% meth, CpH  71-> 66 TpH  92.96% conv
KCNQ1OT1-A4   CpG  31-> 18 TpG  41.94% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-A6   CpG  31->  0 TpG 100.00% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-A7   CpG  31->  3 TpG  90.32% meth, CpH  71-> 63 TpH  88.73% conv
KCNQ1OT1-A10  CpG  31->  0 TpG 100.00% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-B5   CpG  31->  3 TpG  90.32% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-C1   CpG  31->  1 TpG  96.77% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-C2   CpG  31->  2 TpG  93.55% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv
KCNQ1OT1-C3   CpG  31->  0 TpG 100.00% meth, CpH  71-> 71 TpH 100.00% conv


IGF2R intron

== Bisulfite Genomic Sequencing Results ==

Cytosine      #    ..   .          .    .       .   .      ..   #       # 
Summary       Y                                             X   Y       Y 
Genomic       CGAGGCCTGGCATGTTGGGGACAGGTCTTGGGAGCTGACTGGGGGCCTGGCGTGGTGGCG
Reference     YGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGYGTGGTGGYG
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-A5      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-A7      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTCTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-A8      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-A9      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-A10     CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-B1      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-B3      TGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGTGTGGTGGTG
IGF2R-B5      TGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGCGTGGTGGCG
IGF2R-B6      CGAGGTTTGGTATGTTGGGGATAGGTTTTGGGAGTTGATTGGGGGTTTGGTGTGGTGGCG

Cytosine       .  ..# .   ...  ..   ...    .       .# #    . .  #  .. . # 
Summary             Y                               Y Y         Y       Y 
Genomic       GCAGCCCGCAGTCCCTGCCTGGCCCTTGTCTGGGAGGCCGCGGTTCTCTGCGGCCTCTCG
Reference     GTAGTTYGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTYGYGGTTTTTTGYGGTTTTTYG
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-A5      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGTGGTTTTTCG
IGF2R-A7      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-A8      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-A9      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-A10     GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-B1      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG
IGF2R-B3      GTAGTTTGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGTGGTTTTTTGTGGTTTTTTG
IGF2R-B5      GTAGTTTGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTTGTGGTTTTTTGTGGTTTTTCG
IGF2R-B6      GTAGTTCGTAGTTTTTGTTTGGTTTTTGTTTGGGAGGTCGCGGTTTTTTGCGGTTTTTCG

Cytosine      .#     # ...    .. .    .  #       .#  #              # ...#
Summary        Y  P  Y                   Y        Y  Y              Y    Y
Genomic       CCGGKGTCGCCCTTGGCCACTGGGCTGCGAGGAAGCCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGCCCC
Reference     TYGGKGTYGTTTTTGGTTATTGGGTTGYGAGGAAGTYGGYGAGGAGTGGGTGTGYGTTTY
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-A5      TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-A7      TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-A8      TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-A9      TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-A10     TCGGGGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-B1      TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-B3      TTGGTGTTGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTTGGTGAGGAGTGGGTGTGTGTTTT
IGF2R-B5      TTGGTGTTGTTTTTGGTTATTGGGTTGTGAGGAAGTTGGCGAGGAGTGGGTGTGCGTTTC
IGF2R-B6      TCGGTGTCGTTTTTGGTTATTGGGTTGCGAGGAAGTCGGCGAGGAGTGGGTGTGTGTTTC

Cytosine       ..#  . .  .#  #        .     .# ..  #    .#   #  .     . . 
Summary          Y        Y  Y               Y     M     Y   M            
Genomic       GCCCGGCTCTACCGGCGAGGGATGCAGTGGCCGCCAGCGTGGCCGTGCGGCTGGGTCACT
Reference     GTTYGGTTTTATYGGYGAGGGATGTAGTGGTYGTTAGYGTGGTYGTGYGGTTGGGTTATT
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-A5      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-A7      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-A8      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-A9      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-A10     GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-B1      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-B3      GTTTGGTTTTATTGGTGAGGGATGTAGTGGTTGTTAGCGTGGTTGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-B5      GTTCGGTTTTATTGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT
IGF2R-B6      GTTCGGTTTTATCGGCGAGGGATGTAGTGGTCGTTAGCGTGGTCGTGCGGTTGGGTTATT

Cytosine      ...  ..# .  ..    ..     .  .. ..     .    #    ..# . .     
Summary              Y                  E         EEX    Y      Y         
Genomic       CCCTTCCCGCTTCCAGGGCCTTTTTCTGCCTCCTTTT-CAGGACGTGACCCGCACATTAT
Reference     TTTTTTTYGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGAYGTGATTYGTATATTAT
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-A5      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-A7      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-A8      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTT-GTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-A9      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-A10     TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTT-GTTTTTTTT--TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-B1      TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-B3      TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGACGTGATTCGTATATTAT
IGF2R-B5      TTTTTTTTGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-TAGGATGTGATTTGTATATTAT
IGF2R-B6      TTTTTTTCGTTTTTAGGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT-CAGGACGTGATTCGTATATTAT

Cytosine            ..#       . .    . .        . ...          .      #   
Summary               Y                                               M   
Genomic       GAGGGACCCGTAGGGGCTCTTGACACAGAGGGGTCACCCTATGTGTGAACAGGTTACGAG
Reference     GAGGGATTYGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTAYGAG
------------  ------------------------------------------------------------
IGF2R-A4      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-A5      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-A7      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-A8      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-A9      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-A10     GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-B1      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-B3      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-B5      GAGGGATTTGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG
IGF2R-B6      GAGGGATTCGTAGGGGTTTTTGATATAGAGGGGTTATTTTATGTGTGAATAGGTTACGAG

== Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates ==

IGF2R-A4      CpG  27->  0 TpG 100.00% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-A5      CpG  27->  1 TpG  96.30% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-A7      CpG  27->  1 TpG  96.30% meth, CpH  84-> 83 TpH  98.81% conv
IGF2R-A8      CpG  27->  1 TpG  96.30% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-A9      CpG  27->  0 TpG 100.00% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-A10     CpG  27->  0 TpG 100.00% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-B1      CpG  27->  2 TpG  92.59% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-B3      CpG  27-> 21 TpG  22.22% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-B5      CpG  27-> 14 TpG  48.15% meth, CpH  84-> 84 TpH 100.00% conv
IGF2R-B6      CpG  27->  2 TpG  92.59% meth, CpH  84-> 83 TpH  98.81% conv


SNRPN promoter

== Bisulfite Genomic Sequencing Results ==

Cytosine        .   .#              .     ....  . .  #  .   .   . # ..  # 
Summary              Y                               Y      X     Y     Y 
Genomic       GTCATTCCGGTGAGGGAGGGAGCTGGGACCCCTGCACTGCGGCAAACAAGCACGCCTGCG
Reference     GTTATTTYGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGYGGTAAATAAGTAYGTTTGYG
------------  ------------------------------------------------------------
SNRPN-A1      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAACAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A2      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A3      GTTATTTTGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A4      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A5      GTTATTTTGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGTG
SNRPN-A6      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A7      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A8      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTACGTTTGCG
SNRPN-A10     GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGCGGTAAATAAGTATGTTTGCG
SNRPN-B2      GTTATTTCGGTGAGGGAGGGAGTTGGGATTTTTGTATTGTGGTAAATAAGTACGTTTGCG

Cytosine      #  .# .     .   .   # # .   . .   #           #    ..  .# . 
Summary       M   Y               M M           M           M         M   
Genomic       CGGCCGCAGAGGCAGGCTGGCGCGCATGCTCAGGCGGGGATGTGTGCGAAGCCTGCCGCT
Reference     YGGTYGTAGAGGTAGGTTGGYGYGTATGTTTAGGYGGGGATGTGTGYGAAGTTTGTYGTT
------------  ------------------------------------------------------------
SNRPN-A1      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A2      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A3      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A4      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A5      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A6      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A7      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A8      CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-A10     CGGTCGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT
SNRPN-B2      CGGTTGTAGAGGTAGGTTGGCGCGTATGTTTAGGCGGGGATGTGTGCGAAGTTTGTCGTT

Cytosine       .  .  #    .   # .         #  .# .#       ..   # .  .   .  
Summary              M        M           M   Y  M            M           
Genomic       GCTGCAGCGAGTCTGGCGCAGAGTGGAGCGGCCGCCGGAGATGCCTGACGCATCTGTCTG
Reference     GTTGTAGYGAGTTTGGYGTAGAGTGGAGYGGTYGTYGGAGATGTTTGAYGTATTTGTTTG
------------  ------------------------------------------------------------
SNRPN-A1      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A2      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A3      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTTGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A4      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A5      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A6      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A7      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A8      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-A10     GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG
SNRPN-B2      GTTGTAGCGAGTTTGGCGTAGAGTGGAGCGGTCGTCGGAGATGTTTGACGTATTTGTTTG

Cytosine           #   .     # #       #   .     .  .    .#     .  . . .  
Summary            Y         M M       M                  Y               
Genomic       AGGAGCGGTCAGTGACGCGATGGAGCGGGCAAGGTCAGCTGTGCCGGTGGCTTCTCTCAA
Reference     AGGAGYGGTTAGTGAYGYGATGGAGYGGGTAAGGTTAGTTGTGTYGGTGGTTTTTTTTAA
------------  ------------------------------------------------------------
SNRPN-A1      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A2      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A3      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTTGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A4      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A5      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A6      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A7      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTTGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A8      AGGAGTGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-A10     AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA
SNRPN-B2      AGGAGCGGTTAGTGACGCGATGGAGCGGGTAAGGTTAGTTGTGTCGGTGGTTTTTTTTAA

Cytosine          .  ..       #  .. .       .  
Summary        E              Y                
Genomic       GAGACAGCCTGGGGAGCGGCCACTTTTATTCAT
Reference     GAGATAGTTTGGGGAGYGGTTATTTTTATTTAT
------------  ------------------------------------------------------------
SNRPN-A1      GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A2      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A3      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A4      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A5      GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A6      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A7      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A8      GAGATAGTTTGGGGAGCGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-A10     GGGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT
SNRPN-B2      GAGATAGTTTGGGGAGTGGTTATTTTTATTTAT

== Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates ==

SNRPN-A1      CpG  23->  1 TpG  95.65% meth, CpH  52-> 51 TpH  98.08% conv
SNRPN-A2      CpG  23->  0 TpG 100.00% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A3      CpG  23->  3 TpG  86.96% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A4      CpG  23->  0 TpG 100.00% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A5      CpG  23->  3 TpG  86.96% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A6      CpG  23->  0 TpG 100.00% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A7      CpG  23->  1 TpG  95.65% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A8      CpG  23->  1 TpG  95.65% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-A10     CpG  23->  2 TpG  91.30% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv
SNRPN-B2      CpG  23->  3 TpG  86.96% meth, CpH  52-> 52 TpH 100.00% conv


MEST promoter

== Bisulfite Genomic Sequencing Results ==

Cytosine       #   . .  #  # ..#    . .  .  # .  #  #   #  .         # #  
Summary        Y        Y  Y X Y            Y    Y  Y   Y            Y Y  
Genomic       GCGGGCTCTGCGGCGCCCGGTGCTCTGCAACGCTGCGGCGGGCGGCATGGGATAACGCGG
Reference     GYGGGTTTTGYGGYGTTYGGTGTTTTGTAAYGTTGYGGYGGGYGGTATGGGATAAYGYGG
------------  ------------------------------------------------------------
MEST-A2       GTGGGTTTTGTGGCGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-A3       GCGGGTTTTGCGGCGTTCGGTGTTTTGTAACGTTGCGGCGGGCGGTATGGGATAACGCGG
MEST-A7       GTGGGTTTTGCGGCGTTCGGTGTTTTGTAACGTTGCGGCGGGCGGTATGGGATAACGCGG
MEST-A8       GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-A9       GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-A10      GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-B1       GTGGGTTTTGTGGTGCTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-B4       GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-B5       GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG
MEST-B6       GTGGGTTTTGTGGTGTTTGGTGTTTTGTAATGTTGTGGTGGGTGGTATGGGATAATGTGG

Cytosine      ..      # .#     # .. .# .           #        #            .
Summary               Y  Y     Y     Y             Y        Y             
Genomic       CCATGGTGCGCCGAGATCGCCTCCGCAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGC
Reference     TTATGGTGYGTYGAGATYGTTTTYGTAGGTGAGTGTGYGGTGGGAAYGAGGGGGTGTGGT
------------  ------------------------------------------------------------
MEST-A2       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-A3       TTATGGTGCGTCGAGATCGTTTTCGTAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGT
MEST-A7       TTATGGTGCGTCGAGATCGTTTTCGTAGGTGAGTGTGCGGTGGGAACGAGGGGGTGTGGT
MEST-A8       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-A9       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-A10      TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-B1       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-B4       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-B5       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT
MEST-B6       TTATGGTGTGTTGAGATTGTTTTTGTAGGTGAGTGTGTGGTGGGAATGAGGGGGTGTGGT

Cytosine         #  ...     .     # .   #   #      .      ..#    .#   .   
Summary          Y   X            Y     Y E Y               Y     Y   X   
Genomic       TGGCGGCCCTGGGACTAGGGCGCAGGCGAGCGGAGGACTGTGTGCCCGTGTCCGAGCTGG
Reference     TGGYGGTTTTGGGATTAGGGYGTAGGYGAGYGGAGGATTGTGTGTTYGTGTTYGAGTTGG
------------  ------------------------------------------------------------
MEST-A2       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-A3       TGGCGGTTTTGGGATTAGGGCGTAGGCGAGCGGAGGATTGTGTGTTCGTGTTCGAGTTGG
MEST-A7       TGGCGGTTTTGGGATTAGGGCGTAGGCGGGCGGAGGATTGTGTGTTCGTGTTCGAGTTGG
MEST-A8       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTCGAGTTGG
MEST-A9       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-A10      TGGTGGTCTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-B1       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-B4       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-B5       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGTTGG
MEST-B6       TGGTGGTTTTGGGATTAGGGTGTAGGTGAGTGGAGGATTGTGTGTTTGTGTTTGAGCTGG

Cytosine        .  .. .    #     . .  .#  .   #  . # .   .# # ..# . .  .. 
Summary                    Y     X     Y  X   Y    Y      Y Y   Y      X  
Genomic       GGCTGCCTCTGGGCGAAAACTCTACCGACAGGCGGCACGCATTCCGCGCCCGCTCTGCCT
Reference     GGTTGTTTTTGGGYGAAAATTTTATYGATAGGYGGTAYGTATTTYGYGTTYGTTTTGTTT
------------  ------------------------------------------------------------
MEST-A2       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-A3       GGTTGTTTTTGGGCGAAAACTTTATCGACAGGCGGTACGTATTTCGCGTTCGTTTTGCTT
MEST-A7       GGTTGTTTTTGGGCGAAAATTTTATCGACAGGCGGTACGTATTTCGCGTTCGTTTTGTTT
MEST-A8       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-A9       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-A10      GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-B1       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-B4       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-B5       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT
MEST-B6       GGTTGTTTTTGGGTGAAAATTTTATTGATAGGTGGTATGTATTTTGTGTTTGTTTTGTTT

== Methylation (CpG) and C-to-T Conversion (non-CpG) Rates ==

MEST-A2       CpG  29-> 28 TpG   3.45% meth, CpH  44-> 44 TpH 100.00% conv
MEST-A3       CpG  29->  0 TpG 100.00% meth, CpH  44-> 41 TpH  93.18% conv
MEST-A7       CpG  29->  1 TpG  96.55% meth, CpH  44-> 43 TpH  97.73% conv
MEST-A8       CpG  29-> 28 TpG   3.45% meth, CpH  44-> 44 TpH 100.00% conv
MEST-A9       CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 44 TpH 100.00% conv
MEST-A10      CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 43 TpH  97.73% conv
MEST-B1       CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 43 TpH  97.73% conv
MEST-B4       CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 44 TpH 100.00% conv
MEST-B5       CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 44 TpH 100.00% conv
MEST-B6       CpG  29-> 29 TpG   0.00% meth, CpH  44-> 43 TpH  97.73% conv